Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nbr1P97432 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms