Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp1b3P97370 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b3P97370 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b3P97370 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms