Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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SgcaP82350 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SgcaP82350 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SgcaP82350 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgcaP82350 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SgcaP82350 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgcaP82350 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgcaP82350 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgcaP82350 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SgcaP82350 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgcaP82350 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgcaP82350 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgcaP82350 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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SgcaP82350 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SgcaP82350 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgcaP82350 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SgcaP82350 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SgcaP82350 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SgcaP82350 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SgcaP82350 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcaP82350 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SgcaP82350 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SgcaP82350 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SgcaP82350 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SgcaP82350 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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