Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TgfbiP82198 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms