Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx3P81067 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx3P81067 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx3P81067 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx3P81067 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx3P81067 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms