Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx2P81066 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx2P81066 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx2P81066 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx2P81066 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx2P81066 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx2P81066 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx2P81066 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx2P81066 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx2P81066 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx2P81066 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx2P81066 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms