Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otx1P80205 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otx1P80205 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otx1P80205 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otx1P80205 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms