Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad1P70340 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad1P70340 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad1P70340 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms