Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfi1P70338 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfi1P70338 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms