Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms