Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbdsP70122 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbdsP70122 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SbdsP70122 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SbdsP70122 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SbdsP70122 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SbdsP70122 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SbdsP70122 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SbdsP70122 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms