Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actg1P63260 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actg1P63260 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actg1P63260 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actg1P63260 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actg1P63260 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.4 ms