Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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