Protein–RNA interactions for Protein: P62141

Ppp1cb, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1cbP62141 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1cbP62141 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1cbP62141 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms