Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copz1P61924 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copz1P61924 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Copz1P61924 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms