Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5r1P61809 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5r1P61809 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms