Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg6P61406 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg6P61406 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smg6P61406 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smg6P61406 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smg6P61406 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg6P61406 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg6P61406 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg6P61406 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Smg6P61406 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smg6P61406 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms