Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr3bP59470 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr3bP59470 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr3bP59470 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr3bP59470 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3bP59470 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3bP59470 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3bP59470 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3bP59470 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3bP59470 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3bP59470 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3bP59470 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3bP59470 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3bP59470 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3bP59470 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr3bP59470 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms