Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps5P59438 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps5P59438 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps5P59438 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hps5P59438 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hps5P59438 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hps5P59438 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hps5P59438 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms