Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms