Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsc2P56916 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gsc2P56916 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsc2P56916 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsc2P56916 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gsc2P56916 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsc2P56916 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gsc2P56916 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsc2P56916 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsc2P56916 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsc2P56916 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gsc2P56916 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsc2P56916 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsc2P56916 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsc2P56916 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsc2P56916 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms