Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctbp2P56546 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms