Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckbrP56481 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CckbrP56481 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckbrP56481 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms