Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms