Protein–RNA interactions for Protein: P56384

Atp5g3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5g3P56384 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp5g3P56384 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms