Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Faf1P54731 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Faf1P54731 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Faf1P54731 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Faf1P54731 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Faf1P54731 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms