Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms