Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacnb3P54285 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacnb3P54285 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms