Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms