Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp10P52479 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp10P52479 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp10P52479 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp10P52479 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp10P52479 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp10P52479 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms