Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LumP51885 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LumP51885 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LumP51885 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LumP51885 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LumP51885 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LumP51885 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LumP51885 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LumP51885 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LumP51885 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LumP51885 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LumP51885 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LumP51885 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LumP51885 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LumP51885 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LumP51885 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LumP51885 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LumP51885 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LumP51885 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LumP51885 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LumP51885 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LumP51885 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms