Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defa6P50704 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms