Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl5P50228 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms