Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms