Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms