Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg3P47867 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg3P47867 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg3P47867 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg3P47867 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg3P47867 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scg3P47867 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg3P47867 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg3P47867 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms