Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza1P47753 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza1P47753 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza1P47753 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capza1P47753 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms