Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr3P43300 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr3P43300 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr3P43300 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr3P43300 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr3P43300 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms