Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sept1P42209 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sept1P42209 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sept1P42209 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms