Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp9P41245 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp9P41245 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp9P41245 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Mmp9P41245 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp9P41245 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp9P41245 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Mmp9P41245 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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Mmp9P41245 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp9P41245 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp9P41245 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp9P41245 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp9P41245 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp9P41245 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp9P41245 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp9P41245 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp9P41245 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp9P41245 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp9P41245 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp9P41245 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp9P41245 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp9P41245 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Mmp9P41245 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp9P41245 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Mmp9P41245 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp9P41245 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mmp9P41245 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Mmp9P41245 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Mmp9P41245 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Mmp9P41245 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Mmp9P41245 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Mmp9P41245 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Mmp9P41245 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Mmp9P41245 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp9P41245 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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