Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms