Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk2P38575 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk2P38575 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk2P38575 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Upk2P38575 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Upk2P38575 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Upk2P38575 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Upk2P38575 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Upk2P38575 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk2P38575 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk2P38575 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk2P38575 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms