Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp4P35123 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp4P35123 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp4P35123 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Usp4P35123 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Usp4P35123 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp4P35123 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Usp4P35123 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Usp4P35123 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Usp4P35123 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Usp4P35123 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Usp4P35123 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Usp4P35123 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Usp4P35123 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp4P35123 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp4P35123 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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