Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms