Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms