Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Saa4P31532 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Saa4P31532 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms