Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa2P31245 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms