Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpbP27790 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpbP27790 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpbP27790 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpbP27790 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CenpbP27790 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms