Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xrcc5P27641 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms