Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd8P23463 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd8P23463 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd8P23463 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd8P23463 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd8P23463 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd8P23463 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd8P23463 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd8P23463 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd8P23463 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd8P23463 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd8P23463 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd8P23463 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd8P23463 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd8P23463 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd8P23463 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd8P23463 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd8P23463 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd8P23463 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms